系主任：郝钰，（本系课程负责人和实验课程负责人）
电话：64286973
教学科研秘书：彭桂英
医学病原系由原医学微生物学与免疫学教研室、医学寄生虫学教研室、中西医结合研究所免疫室合并组建，赵琳、薄小泉、柳忠婉、周勇、邱全瑛等老一辈为学科的建立和发展奠定了基础。本系属于中西医结合基础学科，为国家重点学科和国家中医药管理局重点学科，是“211”重点建设项目，为中西医结合基础硕士学位、博士学位授权点。本系有国家中医药管理局中医药科研微生物与免疫三级实验室。
有四个稳定的研究方向：（1）中医药的免疫调节作用；（2）中医药的抗病毒和抗菌作用；（3）中医药的抗肿瘤作用；（4）中医药对自身免疫性疾病的防治。