内经教研室作为国家中医药管理局高水平中医药重点学科—内经重点学科的依托单位，重视科学研究，形成稳定的研究方向并取得相应成果。各个方向先后承担过国家973项目、国家重点研发项目、国家科技部-科技基础资源调查专项的子项目，国家自然基金重点项目、面上项目、青年项目、国家社会科学项目及教育部、北京市等省部级课题，获得多项科研成果，并与时俱进，积极将科研成果反哺于本科教学，为拓展本科生的知识结构、知识层次，加强本科生的创新能力起到了积极的作用。

方向一：中医理论体系的构架与内涵研究

标志性成果：承担国家“973”项目：中医理论体系框架结构研究——中医理论起源、形成与发展的内在规律研究，提出中医理论发展范式：经典传承式，凝练出中医核心观念，搭建“中医经典知识挖掘与传播平台”。

方向二：《黄帝内经》理论与五运六气科学性研究

标志性成果：承担多项国家社科基金、国家自然科学基金项目，归真与还原《内经》理论，阐释了运气学说的现代科学内涵。研究成果发表在T1核心期刊、环境科学与生态学科顶刊《Science of The Total Environment》等。

方向三：五脏藏神理论研究

标志性成果：提出脾胃是五脏藏神的核心环节，揭示脾胃与精神活动密切相关的科学基础。参与制定《中医神志病临床诊疗指南》，并承担“癫痫所致精神障碍”部分的编写。

方向四：《黄帝内经》思维临床应用及文化传承研究

标志性成果：探讨以《内经》为代表的中医药文化传播的多种方式，主编《中医药文化进校园普及读本》，参与组织全国《黄帝内经》知识大赛，出版《翟双庆解读黄帝内经》六册，并系统收藏梳理晚清至新中国成立的医家处方4000余张。