1957年11月，贲长恩教授从中国医科大学调入北京中医药大学（原北京中医学院），在京西斋堂与来自协和医科大学的同事们共同筹建了中医院校首批组织学与胚胎学教研室（1973年组胚教研室随校本部从东直门迁址到和平里校区），承担了全校本科生“组织学与胚胎学”，研究生“医学科研思路方法与程序”“分子细胞学与疾病”等基础课程的教学工作。
1981年组胚教研室被批准设立中西医结合基础硕士点。1986年组胚教研室被批准设立中西医结合基础博士点。1994年组织学与胚胎学被确立为校级重点学科。
2001年组胚教研室申请国家自然基金重点项目“复方鳖甲软肝片防治多器官纤维化的作用及机制”批准立项（课题主持人：牛建昭教授）
2003年组胚教研室成立国内首批数码互动教学实验室（主任：郭顺根教授）
2004年组胚教研室教师的多名老师列入教育部创新团队项目，同年与加拿大McMaster大学医学院分子病理系联合成立“中加抗器官纤维化研究中心”
2012年组胚教研室教师列入教育部、国家外专局中西医结合创新引智基地（111计划）中方骨干（负责人：牛建昭教授）
